Tras colgar las botas, Patxi Salinas ha dirigido a equipos como el Atlético Gramanet, el CD Ourense, la UE Sant Andreu y el Melita FC de Malta antes de hacerse cargo la temporada pasada del Rápido de Bouzas. También estuvo en las categorías inferiores del Athletic como entrenador.
Con el conjunto gallego del Rápido de Bouzas, el técnico vasco consiguió certificar el ascenso a Segunda División B, lo que le permitió recibir la oferta de continuidad, pero finalmente la ha declinado y ha aceptado la propuesta del Burgos CF, cuya directiva se ha vuelto a marcar el reto de intentar dar el salto a Segunda División.
Como jugador del Athletic, Patxi Salinas ganó dos ligas, en las temporadas 82/83 y 83/84, así como una Copa ese último año.
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